Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldnd1Q9CQX5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldnd1Q9CQX5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldnd1Q9CQX5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldnd1Q9CQX5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms