Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PsenenQ9CQR7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PsenenQ9CQR7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PsenenQ9CQR7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms