Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nicn1Q9CQM0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nicn1Q9CQM0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nicn1Q9CQM0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms