Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccer1Q9CQL2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccer1Q9CQL2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccer1Q9CQL2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms