Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rwdd1Q9CQK7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rwdd1Q9CQK7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rwdd1Q9CQK7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rwdd1Q9CQK7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109 ms