Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Higd2aQ9CQJ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Higd2aQ9CQJ1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Higd2aQ9CQJ1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms