Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RTRAFQ9CQE8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RTRAFQ9CQE8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTRAFQ9CQE8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms