Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ91

Ndufa3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa3Q9CQ91 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ndufa3Q9CQ91 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufa3Q9CQ91 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms