Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
1700129C05RikQ9CQ77 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
1700129C05RikQ9CQ77 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms