Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
2010109I03RikQ9CQ11 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.05■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
2010109I03RikQ9CQ11 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
2010109I03RikQ9CQ11 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms