Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ska1Q9CPV1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ska1Q9CPV1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ska1Q9CPV1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms