Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn6Q99PL6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ubxn6Q99PL6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubxn6Q99PL6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubxn6Q99PL6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms