Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
4930550L24RikQ99PA7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4930550L24RikQ99PA7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms