Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trem2Q99NH8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trem2Q99NH8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trem2Q99NH8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms