Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NsmfQ99NF2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NsmfQ99NF2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NsmfQ99NF2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NsmfQ99NF2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms