Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Hdac9Q99N13 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hdac9Q99N13 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hdac9Q99N13 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms