Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ms4a4dQ99N05 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a4dQ99N05 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4dQ99N05 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms