Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramel1Q99MW3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramel1Q99MW3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pramel1Q99MW3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pramel1Q99MW3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 985.9 ms