Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME2

Wdr6, WD repeat-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr6Q99ME2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr6Q99ME2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr6Q99ME2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Wdr6Q99ME2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr6Q99ME2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Wdr6Q99ME2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr6Q99ME2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms