Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms