Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nmd3Q99L48 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nmd3Q99L48 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms