Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms