Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmp1Q99KU0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmp1Q99KU0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms