Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PpifQ99KR7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PpifQ99KR7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PpifQ99KR7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms