Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hps4Q99KG7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Hps4Q99KG7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hps4Q99KG7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hps4Q99KG7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hps4Q99KG7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hps4Q99KG7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms