Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dok4Q99KE3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dok4Q99KE3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dok4Q99KE3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dok4Q99KE3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms