Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GatbQ99JT1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GatbQ99JT1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GatbQ99JT1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms