Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Apobec3Q99J72 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Apobec3Q99J72 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Apobec3Q99J72 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Apobec3Q99J72 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212.3 ms