Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim11aQ99J19 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smim11aQ99J19 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim11aQ99J19 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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