Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctu1Q99J10 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctu1Q99J10 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms