Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PdgfdQ925I7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PdgfdQ925I7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PdgfdQ925I7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PdgfdQ925I7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms