Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rtn4ip1Q924D0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtn4ip1Q924D0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms