Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sf3b3Q921M3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sf3b3Q921M3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sf3b3Q921M3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms