Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sh3bp4Q921I6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sh3bp4Q921I6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sh3bp4Q921I6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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