Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med28Q920D3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med28Q920D3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med28Q920D3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms