Protein–RNA interactions for Protein: Q91YT2

Rnf185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf185Q91YT2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rnf185Q91YT2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rnf185Q91YT2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf185Q91YT2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rnf185Q91YT2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Rnf185Q91YT2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rnf185Q91YT2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rnf185Q91YT2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rnf185Q91YT2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnf185Q91YT2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Rnf185Q91YT2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Rnf185Q91YT2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rnf185Q91YT2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rnf185Q91YT2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnf185Q91YT2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnf185Q91YT2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms