Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Basp1Q91XV3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Basp1Q91XV3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Basp1Q91XV3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.6 ms