Protein–RNA interactions for Protein: Q91XB0

Trex1, Three-prime repair exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex1Q91XB0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trex1Q91XB0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trex1Q91XB0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trex1Q91XB0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trex1Q91XB0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trex1Q91XB0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms