Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ApofQ91V80 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ApofQ91V80 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ApofQ91V80 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ApofQ91V80 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ApofQ91V80 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApofQ91V80 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApofQ91V80 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ApofQ91V80 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ApofQ91V80 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ApofQ91V80 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ApofQ91V80 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApofQ91V80 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApofQ91V80 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ApofQ91V80 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApofQ91V80 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApofQ91V80 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ApofQ91V80 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ApofQ91V80 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApofQ91V80 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ApofQ91V80 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ApofQ91V80 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ApofQ91V80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ApofQ91V80 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApofQ91V80 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ApofQ91V80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApofQ91V80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ApofQ91V80 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApofQ91V80 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ApofQ91V80 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ApofQ91V80 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ApofQ91V80 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ApofQ91V80 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApofQ91V80 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApofQ91V80 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ApofQ91V80 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApofQ91V80 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ApofQ91V80 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApofQ91V80 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApofQ91V80 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ApofQ91V80 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ApofQ91V80 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApofQ91V80 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ApofQ91V80 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ApofQ91V80 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ApofQ91V80 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms