Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Crb1Q8VHS2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Crb1Q8VHS2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Crb1Q8VHS2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms