Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI4

Carf, Calcium-responsive transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CarfQ8VHI4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CarfQ8VHI4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CarfQ8VHI4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CarfQ8VHI4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms