Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cabp4Q8VHC5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cabp4Q8VHC5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cabp4Q8VHC5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cabp4Q8VHC5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cabp4Q8VHC5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms