Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc71Q8VEG0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc71Q8VEG0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 543.2 ms