Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cul7Q8VE73 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cul7Q8VE73 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cul7Q8VE73 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Cul7Q8VE73 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Cul7Q8VE73 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Cul7Q8VE73 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms