Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Uhrf1Q8VDF2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uhrf1Q8VDF2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Uhrf1Q8VDF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Uhrf1Q8VDF2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms