Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fam20bQ8VCS3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam20bQ8VCS3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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