Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCA5

Tmprss4, Transmembrane protease serine 4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss4Q8VCA5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmprss4Q8VCA5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmprss4Q8VCA5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmprss4Q8VCA5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmprss4Q8VCA5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms