Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nae1Q8VBW6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nae1Q8VBW6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms