Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0G9

Nup133, Nuclear pore complex protein Nup133, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup133Q8R0G9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nup133Q8R0G9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nup133Q8R0G9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nup133Q8R0G9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nup133Q8R0G9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms