Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MyripQ8K3I4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MyripQ8K3I4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MyripQ8K3I4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MyripQ8K3I4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms